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吉林医药学院面向全国招生,学校服务面向基层卫生单位,努力契合地方经济社会发展需求,培养了大批医疗服务、药品生产、销售和卫生管理的一线应用型人才。毕业生初次就业率保持在83%以上,居省内高校前列。1996年起,学校与白求恩医科大学联合培养硕士研究生,1999年起作为第四军医大学的分院独立开展研究生教育,拥有二级学科授权点12个。现与吉林大学、第四军医大学、延边大学、吉林师范大学联合培养研究生,受聘博、硕导师34人。